فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1

فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة أوفيروس سارس (فيروس كورونا يسبب متلازمة تنفسية حادة وخيمة (سارس)، وهوسبب وباء سارس سنة 2003. ظهر الفيروس في نوفمبر 2002 في مقاطعة غوانغدونغ بالصين، وتسبب بين 1 نوفمبر 2002 و31 أغسطس 2003 في إصابة 8096 إنسان من 29 بلد مخلفا 774 وفاة أغلبها في الصين، هونغ كونغ، تايوان وجنوب شرق آسيا. وهوفيروس رنا أحادي السلسلة موجب الاتجاه (المجموعة أربعة من تصنيف بلتيمور) من جنس فيروس كورونا بيتا.

في 16 أبريل 2003 عقب تفشي سارس في آسيا وحالات ثانوية في أماكن أخرى من العالم، أصدرت منظمة الصحة العالمية بيانا صحفيا تقول فيه حتى فيروس كورونا الذي تم تحديده بواسطة عدة مختبرات هوالسبب الرئيسي لمتلازمة سارس. واحتُفظ بعينات من الفيروس في مختبرات بمدينة نيويورك، سان فرانسيسكو، مانيلا، هونغ كونغ وتورونتو.

حددت مراكز مكافحة الأمراض واتقائها في الولايات المتحدة ومختبر فهم الأحياء المجهري الوطني (جامعة إراسموس روتردام بهولندا حتى فيروس كورونا سارس يستوفي فرضيات كوخ وبذلك تم تأكيد أنه عامل مسبب للأمراض. وفي التجارب على القرود، طورت قرود المكاك المصابة بالفيروس نفس أعراض سارس التي يطورها المصابون به لدى البشر.

فيروس كورونا سارس هوواحد من عدة فيروسات حددتها منظمة الصحة العالمية بأنها على الأرجح يمكن حتى تسبب وباءات عالمية مستقبلية وذلك في إطار خطة جديدة استُحدثت بعد وباء إيبولا للبحث والتطوير العاجل -قبل وأثناء الوباء- لاختبارات تشخيص، ولقاحات وأدوية.

المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (سارس)

صورة بالأشعة السينية لصدر مريض بسارس تُظهر عتامة، وهي مؤشر على الإصابة بذات الرئة.

المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة أوسارس هوسقم تنفسي فيروسي من أصل حيواني المنشأ يسببه فيروس كورونا سارس. ويُحدث هذا الفيروس في الغالب سقما وخيما تدل عليه أعراض أولية شبيهة بأعراض الأنفلونزا هي: ألم عضلي، صداع وحمى يعقبها بعد 2-14 يوما بداية الأعراض التنفسية: السعال، التهاب الحلق، ضيق النفس وربما يؤدي في النهاية إلى ذات الرئة سواء ذات الرئة الفيروسي بشكل مباشر أوذات الرئة البكتيري. هناك عرض آخر رائج لدى سقمى سارس وهوانخفاض أعداد الخلايا اللمفاوية في الدم. والعرض الوحيد الشائع بين جميع السقمى هوازدياد درجة الحرارة إلى 38°. متوسط فترة حضانة فيروس سارس بين 4-6 أيام، ونادرا ماتكون قصيرة ليوم واحد أوطويلة حتى 14 يوما.

المسار الرئيسي لانتنطق سارس هواتصال الغشاء المخاطي بالقطرات التنفسية لمريض آخر أوأداة العدوى. رغم حتى الإسهال عرض رائج بين المصابين بسارس، إلا حتى المسار الفموي الشرجي لا يظهر بأنه وسيلة انتنطق شائعة.عدد التكاثر الأساسي لفيروس سارس (R0) يتراوح بين 2-4 حسب مختلف الدراسات. خفضت تدابير الوقاية المستحدثة في أبريل 2003 الرقم إلى 0.4.

عقب تفشي سارس سنة 2003، توفي حوالي 9% من السقمى المؤكد إصابتهم بسارس. معدل الوفيات كان أعلى بكثير بين الأفراد الذين تجاوز عمرهم الستين بنسبة تقترب من 50% لدى هذه الفئة الفرعية من السقمى.

تاريخ

في أبريل 2003، أنهى فهماء يعملون في مركز مايكل سميث لعلوم الجينوم في فانكوفر بكندا موضعة (تحديد مواضع) التسلسل الجيني لفيروس كورونًا اعتُقد أنه مرتبط بسقم سارس، عمل الفريق بقيادة الدكتور ماركومارا بالتعاون مع مركز كولومبيا البريطانية لمكافحة الأمراض ومختبر فهم الأحياء المجهري الوطني في وينيبيغ، مانيتوبا باستخدام عينات من سقمى مصابين بالفيروس في تورونتو. تمت مشاركة التسلسل المحدد -الذي اعتُبر من قبل منظمة الصحة العالمية كخطوة مهمة نحومحاربة سارس- مع فهماء في مختلف أنحاء العالم عبر مسقط إلكتروني GSC. وصف الدكتور دونالد لومن مستشفى جبل سيناء بتورونتوتحديد التسلسل بأنه أنُجِز "بسرعة غير مسبوقة". بعد ذلك تم تأكيد تسلسل فيروس كورونا سارس بواسطة الكثير من المجموعات المستقلة.

في نهاية مايو2003، وجدت دراسات لعيناتِ حيواناتٍ بريةٍ تباع كغذاء في سوق محلي بغوانغدونغ، الصين أنه يمكن استخلاص فيروس سارس من زباد النخل المقنع، لكن هذه الحيوانات لم تُظهِرأعراضا سريرية في جميع الحالات، وكانت الخلاصة الأولية حتى فيروس سارس تجاوز حاجز الانتنطق الأجنبي من زباد النخل إلى البشر، وتم اغتال ما يزيد عن 10آلاف زباد نخل في مقاطعة غوانغدونغ. وُجِد لاحقا حتى الفيروس يتواجد كذلك في كلاب الراكون، غريرات ابن مقرض والقطط الأليفة. في 2005، حددت دراستان عددا من فيروسات كورونا الشبيهة بسارس لدى الخفاش الصيني. أشارت دراسات تطور السلالات إلى احتمالية عالية لكون أصل فيروس كورنا سارس من الخفافيش ثم انتقل إلى البشر إما مباشرة أوعبر حيوانات تواجدت في أسواق صينية. لم تظهر الخفافيش أي أعراض جلية للسقم، لكنها على الأرجح الخزانات الطبيعية لفيروسات كورونا الشبيهة بسارس. في نهاية 2006، وضع فهماء من مركز مكافحة الأمراض والوقاية في جامعة هونغ كونغ ومركز غوانزولمكافحة الأمراض والوقاية رابطا جينيا بين فيروس كورونا سارس الظاهر لدى زباد النخل والبشر، مؤكدين افتراضاتٍ بأن هذا السقم انتقل بين الأنواع.

فهم الفيروسات

صورة بالمجهر الإلكتروني الماسح لفيروسات كورونا سارس.

فيروس كورونا هوفيروس رنا مفرد السلسلة موجب الاتجاه ينتمي إلى عائلةٍ من فيروسات كورونا المغلفة، جينومه حوالي 29.7 ألف نوكلوتيد وهومن أكبر فيروسات الرنا طولا. لفيروس سارس 13 جينا معروفا و14 بروتينا معروفا. تحتوي المنطقة 5' غير المترجمة (إطاري قراءة مفتوحين (ORF) 1a و1b، وكلاهما عديد بروتين.

وظيفة الكثير من هذه البروتينات معروفة: يشفر إطاري القراءة المفتوحين 1a و1b إنزيم الريبليكاز، وأربع بروتينات بنيوية رئيسية: القفيصة، الحسكة، الغشاء، والغلاف. ويشفران كذلك ثمانية بروتينات فريدة تُعهد بالبروتينات الملحقة وجميعها لا يوجد لديها نظير معروف لدى فيروسات أخرى. وظيفة هذه البروتينات الملحقة مازالت غير معروفة.

عادة ما تعبِّر فيروسات كورونا عن عديد البروتين pp1a (عديد بروتين إطار القراءة المفتوح 1a) وPP1ab وهوعديد بروتين كلا إطاري القراءة المفتوحين 1a و1b. بعد ذلك تعالَج عديدات البروتين بواسطة إنزيمات يشفِّرها إطارة القراءة المفتوح 1a، وينتج عن ذلك بروتينات منها: إنزيمات النسخ مثل بوليميراز الرنا المعتمد على الرنا، هيليكاز الرنا، والبروتياز. مركب التضاعف الخاص بفيروسات كورونا مسؤول كذلك على تخليق مختلف جزيئات الرنا مع مسار إطار القراءة المفتوح 1b والتي تشفر بروتينات ملحقة. يقص بروتينان مختلفان هما 3CLpro وPL2pro عديدات البروتينات الكبيرة إلى 16 وحدة فرعية صغيرة.

يتبع فيروس كورونا سارس نفس إستراتيجية التضاعف الخاصة بجنس فيروسات كورونا. حُدِّد المستقبل الرئيسي لفيروس سارس وهوالإنزيم المحول للأنجيوتنسين 2 أول مرة سنة 2003.

الشكل

يُعتبر شكل فيروس السارس مماثلًا لفيروسات كورونا عمومًا. تحتوي هذه الفيروسات على جزيئاتٍ كرويةٍ كبيرة ذات بروزاتٍ سطحية بصلية تُشكل هالةً حول الجزيئات. يحتوي غلاف الفيروس على ليبيدات، ويظهر أنه يتكونُ من زوجٍ مميزٍ من القشور الإلكترونية الكثيفة.

يتكون المُكون الداخلي من بروتينٍ نووي حلزوني مُنفرد. يُوجد أيضًا بروزاتٌ سطحية طويلة تبرز من الغلاف الليبيدي. حجم هذه الجزيئات ضمن نطاق 80-90 نانومتر.

التطور

فيروس كورونا سارس ذوصلة وثيقة بالمجموعة 2 من فيروسات كورونا (فيروس كورونا بيتا) لكنه لا ينفصل عن أي من المجموعات الثلاث الأخرى من فيروسات كورونا (ألفا، غاما، دلتا). اقتُرحت فرضية بأن فيروسات كورونا تطورت بشكل مشهجر مع مضيفاتها لمدة طويلة ثم انتقلت عبر الأنواع من الخفافيش إلى البشر. أقرب مجموعة خارجة صلةً بفيروسات كورونا هي فيروسات توروالتي تماثلها في ريبليكاز إطار القراءة المفتوح 1b والبروتينات الفيروسية S وM. حُدِّد حتى سارس هوتفرع مبكر من المجموعة بيتا من فيروسات كورونا بناءا على مجموعة من النطاقات المحفوظة التي يشهجر فيها مع المجموعة بيتا.

الاختلاف الرئيسي بين فيروس كورونا بيتا وفيروس كورونا سارس هوالوحدة الفرعية الخاصة بالريبليكاز nsp3 المشفَّرة بإطار القراءة المفتوح 1a. لا يملك فيروس سارس ببتيداز 1 شبيه بالباباين.

انظر أيضًا

كارلوأورباني

المراجع

^ Thiel V (editor). (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (الطبعة 1st). Caister Academic Press. ISBN .
^ WHO, المحرر (31 décembre 2003). "Summary of probable SARS cases with onset of illness from 1 November 2002 to 31 July 2003". اطلع عليه بتاريخ 14 septembre 2019. . نسخة محفوظة أربعة أبريل 2020 على مسقط واي باك مشين.
^ "Remembering SARS: A Deadly Puzzle and the Efforts to Solve It". Centers for Disease Control and Prevention. 11 أبريل 2013. مؤرشف من الأصل في 01 أغسطس 2013. اطلع عليه بتاريخ ثلاثة أغسطس 2013.
^ "Coronavirus never before seen in humans is the cause of SARS". United Nations World Health Organization. 16 أبريل 2006. مؤرشف من الأصل في 12 أغسطس 2004. اطلع عليه بتاريخخمسة يوليو2006.
^ Fouchier RA, Kuiken T, Schutten M, et al. (2003). "Aetiology: Koch's postulates fulfilled for SARS virus". Nature. 423 (6937): 240. Bibcode:2003Natur.423..240F. doi:10.1038/423240a. PMID 12748632.
^ Kieny, Marie-Paule. "After Ebola, a Blueprint Emerges to Jump-Start R&D". Scientific American Blog Network. مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2016. اطلع عليه بتاريخ 13 ديسمبر 2016.
^ "LIST OF PATHOGENS". World Health Organization. مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2016. اطلع عليه بتاريخ 13 ديسمبر 2016.
^ Chan-Yeung M; Xu RH (نوفمبر 2003). "SARS: epidemiology". Respirology (Carlton, Vic.). 8 (Suppl): S9–14. doi:10.1046/j.1440-1843.2003.00518.x. PMID 15018127.
^ Yang M; Li CK; Li K; Hon KL; Ng MH; Chan PK; Fok TF (أغسطس 2004). "Hematological findings in SARS patients and possible mechanisms (review)". International Journal of Molecular Medicine. 14 (2): 311–5. doi:10.3892/ijmm.14.2.311. PMID 15254784. مؤرشف من الأصل في 24 سبتمبر 2015.
↑ World Health Organization (2003). "Consensus document on the epidemiology of severe acute respiratory syndrome (SARS)" (باللغة الإنجليزية). hdl:10665/70863.
↑ Sørensen MD; Sørensen B; Gonzalez-Dosal R; Melchjorsen CJ; Weibel J; Wang J; Jun CW; Huanming Y; Kristensen P (مايو2006). "Severe acute respiratory syndrome (SARS): development of diagnostics and antivirals". Annals of the New York Academy of Sciences. 1067 (1): 500–5. Bibcode:2006NYASA1067..500S. doi:10.1196/annals.1354.072. PMID 16804033.
^ "B.C. lab cracks suspected SARS code". CBCNews, Canada. أبريل 2003. مؤرشف من الأصل في 26 نوفمبر 2007.
^ Li W, Shi Z, Yu M, et al. (2005). "Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses". Science. 310 (5748): 676–9. Bibcode:2005Sci...310..676L. doi:10.1126/science.1118391. PMID 16195424.
^ Lau SK, Woo PC, Li KS, et al. (2005). "Severe acute respiratory syndrome coronavirus-like virus in Chinese horseshoe bats". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (39): 14040–5. Bibcode:2005PNAS..10214040L. doi:10.1073/pnas.0506735102. PMC 1236580. PMID 16169905.
^ "Scientists prove SARS-civet cat link". China Daily. 23 نوفمبر 2006. مؤرشف من الأصل في 14 يونيو2011.
^ McBride R; Fielding BC (نوفمبر 2012). "The role of severe syndrome (SARS)-coronavirus accessory proteins in virus pathogenesis". Viruses. 4 (11): 2902–23. doi:10.3390/v4112902. PMC 3509677. PMID 23202509.
^ McBride, Ruth; Fielding, Burtram C. (2012-11-07). "The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis". Viruses. 4 (11): 2902–2923. doi:10.3390/v4112902. ISSN 1999-4915. PMC 3509677. PMID 23202509.
^ Li, Wenhui; Moore, Michael J.; Vasilieva, Natalya; Sui, Jianhua; Wong, Swee Kee; Berne, Michael A.; Somasundaran, Mohan; Sullivan, John L.; Luzuriaga, Katherine; Greenough, Thomas C.; Choe, Hyeryun (نوفمبر 2003). "Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus". Nature (باللغة الإنجليزية). 426 (6965): 450–454. doi:10.1038/nature02145. ISSN 0028-0836. PMID 14647384.
^ Cui J; Han N; Streicker D; Li G; Tang X; Shi Z; Hu Z; Zhao G; Fontanet A; Guan Y; Wang L; Jones G; Field HE; Daszak P; Zhang S (أكتوبر 2007). "Evolutionary relationships between bat coronaviruses and their hosts". Emerg. Infect. Dis. 13 (10): 1526–32. doi:10.3201/eid1310.070448. PMC 2851503. PMID 18258002.
^ Ge XY; Li JL; Yang XL; Chmura AA; Zhu G; Epstein JH; Mazet JK; Hu B; Zhang W; Peng C; Zhang YJ; Luo CM; Tan B; Wang N; Zhu Y; Crameri G; Zhang SY; Wang LF; Daszak P; Shi ZL (نوفمبر 28, 2013). "Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor". Nature. 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. doi:10.1038/nature12711. PMC 5389864. PMID 24172901.

مراجع إضافية

Peiris JS, Lai ST, Poon LL, et al. (أبريل 2003). "Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome". Lancet. 361 (9366): 1319–25. doi:10.1016/s0140-6736(03)13077-2. PMID 12711465.
Rota PA, Oberste MS, Monroe SS, et al. (30 مايو2003). "Characterization of a Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome". Science. 300 (5624): 1394–9. Bibcode:2003Sci...300.1394R. doi:10.1126/science.1085952. PMID 12730500.
Marco A. Marra; et al. (30 مايو2003). "The Genome Sequence of the SARS-Associated coronavirus". Science. 300 (5624): 1399–1404. Bibcode:2003Sci...300.1399M. doi:10.1126/science.1085953. PMID 12730501.
Snijder EJ, et al. (29 أغسطس 2003). "Unique and conserved features of genome and proteome of SARS-coronavirus, an early split-off from the coronavirus group 2 lineage". J Mol Biol. 331 (5): 991–1004. CiteSeerX = 10.1.1.319.7007 10.1.1.319.7007. doi:10.1016/S0022-2836(03)00865-9. PMID 12927536.
Yount B, et al. (15 أغسطس 2006). "Rewiring the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) transcription circuit: engineering a recombination-resistant genome". Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (33): 12546–51. Bibcode:2006PNAS..10312546Y. doi:10.1073/pnas.0605438103. PMC 1531645. PMID 16891412. مؤرشف من الأصل في 29 أكتوبر 2012.
Thiel V, المحرر (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (الطبعة 1st). Caister Academic Press. ISBN .
Enjuanes L, et al. (2008). "Coronavirus Replication and Interaction with Host". Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN .

روابط خارجية

WHO press release identifying and naming the SARS virus
The SARS virus genetic map
special on the SARS virus (free content: no registration required)
McGill University SARS Resources على مسقط واي باك مشين (نسخة محفوظة 1 مارس 2005)
U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) SARS home
World Health Organization on alert